Le thème principal c'est la solitude
Du début jusqu'à la fin, Naruto fut/est/sera seul. Ce gros nettoyage n'est pas anodin, le village, ses sensei, ses amis, tous les liens que notre cher tête blonde crée, disparaissent petit à petit. Il est évident qu'il perdra Sasuke ainsi que tous ces proches... soit ils crêveront tous de ces propres mains ou de potentiels futurs ennemis, soit ils le fuiront à cause du monstre qu'il transporte, tel un cycle qui recommence, il devra partir, s'exiler et créer de nouveaux liens qu'il perdra également et ainsi de suite!
Le Destin de Naruto est d'être seul, sa volonté le pousse à lutté contre ce tragique destin et là on se retrouve avec une question philosophique qui taraude l'esprit humain depuis son apparition : Peut-on interagir avec son destin ? Le Modeler ? Ou bien est-ce que tout est écrit à l'avance ? Peut être que vouloir le changer n'est qu'une illusion, car cette pensée fut écrite elle aussi bien avant sa naissance....