Blue Reflection est un RPG dans lequel vous incarnez Hinako, une écolière japonaise et ancienne danseuse ayant abandonné son rêve à cause d'une blessure à la jambe. Un jour Yuzuki et Raimu, deux jeunes filles mystérieuses, vous approche et vous donne le pouvoir de devenir une Magical Girl du nom de "Reflector". Sous cette forme, vous devez combattre le mal et comprendre pourquoi ces pouvoirs vous ont été confiés.