Paraissant fort, cool et résolut, Sephiroth était l´exemple même du type du SOLDAT. Possédant une force exceptionnelle avec son sabre extrêmement destructeur, le Masamune, Sephiroth parcourait le monde pour le compte de la Shinra Inc. Mais il compris bientôt que la force qu´il possédait lui venait de fait surnaturels.
Avec Zack, un SOLDAT de première classe, et Cloud, un soldat de Shinra Inc, Sephiroth entra dans le réacteur Mako contenant un grand nombre de capsules occupées par des organismes vivants ayant étés crées à partir des cellules de Jenova. S´apercevant que le nom de l´organisme extraterrestre et celui de sa mère était le même, Sephiroth commença pour la première fois à comprendre vraiment qui il était. Troublé par cette révélation, il décida de procéder à des recherches dans son passé grâces aux documents contenus dans le château Shinra. pour cela, il lut les journaux laissés par le professeur Gast, qui n´etait d´autre que le père d´Aeris.
D´après les notes de Gast, un projet fut crée pour rechercher le pouvoir d´une race légendaire, connue sous le nom des Cetra, ou des Anciens. Cette race supérieure était supposée être associée avec la terre promise, un endroit ou l´on pouvait trouver le bonheur suprême et ou la Mako serait abondante, et exploitable. La Shinra, le créateur des infâmes "réacteurs Mako" tente de retrouver cette Terre promise pour en voler l´énergie Mako. 2000 ans avant, une forme de vie inconnue fut trouvée dans une strate géologique, et fut erronément identifiée comme étant une descendante des Cetra, et fut nommée Jenova. C´est ainsi que naquit le projet Jenova, et Gast était le dirigeant de ce projet scientifique.
La Shinra, cherchant à reproduire le pouvoir des Cetra, chargea Gast de produire une race de combattants possédant les pouvoirs exceptionnels et la force des Cetra. Les spécimens furent donc placés dans des capsules et soumis à d´intenses quantités d´énergie Mako, et on leur injecta également des cellules provenant de Jenova. Ces spécimens, une fois leur transformation achevée, deviendrons plus tard le corps d´élite de le Shinra.
Choqué d´avoir découvert qu´il était lui-même le résultat d´une expérience scientifique démente, Sephiroth s´isola dans la bibliothèque de Gast et devint plus tard fou, avant de brûler la ville de Nibel et de massacrer tout ses habitants. Entrant dans le réacteur Mako, il alla voir sa mère, Jenova, qui était placée ici pour nourrir ses enfants incubant dans les capsules. Zack, essayant de stopper la folie de sephiroth, fut sérieusement blessée durant le combat contre son supérieur. Mais c´est Cloud, alors simple soldat, qui blesse Sephiroth et le fait tomber dans le réacteur. Shinra fidèle à sa conduite politique, reconstruit la ville et engagea des acteurs pour dissimuler à tous ce q´il s´est passé. Jenova fut ramenée au quartier général de la Shinra, ou Hojo et Gast continuèrent à chercher l´origine des Anciens.
Bien que son corps aie été endommagé, Sephiroth était quasi-invincible grâce au pouvoir des cellules de Jenova. Après avoir récupéré le corps de sa mère, Sephiroth pouvait enfin exprimer sa haine envers le monde, et sa soif de destruction. En travers de sa route se trouva Aeris Gainsborought, la fille du professeur Gast et d´Ifalna, une véritable descendante des Cetra. Aeris, capable de communiquer avec la Planète, avait trouvé un moyen de stopper les plans de Sephiroth. Dans la citée des anciens, elle fut tuée de la main de Sephiroth, mais grâce à sa mort, il y avait un moyen de sauver la terre, car Sephiroth ne s´interessait pas à la Terre Promise, mais seulement à la Materia noire et au Météore pour détruire le monde. En effet, la chute du météore causerait une énorme blessure à la terre, et pour se soigner, elle envoierai toute son énergie sur cette blessure pour la colmater. Sephiroth voulait donc voler cette énergie en se plaçant à l´endroit même de cette blessure, ou une intense concentration d´énergie se formerait.
Cloud et ses compagnons, après avoir retrouvé la Materia Noire une seconde fois, se rendirent au cratère situé à l´hemisphère nord de la planète, ou se trouvait le corps de Sephiroth. Cloud ignorait lui même q´il était aussi une création de Hojo, un humain ayant eu des cellules de Jenova injectées en lui. En lui se déroulait un combat intérieur entre sa propre personnalité et le besoin incessant d´obéir à l´appel de Jenova. Mais Cloud perdit la bataille mentale, et donna le Materia noire à Sephiroth, qui aussitôt convoqua le Météore. Mais finalement, ce fut Cloud qui tua Sephiroth. Il retrouva sa véritable indentée grâce à l´aide de Tifa Lockheart.
Même si les actes de Sephiroth étaient guidés par le mal, il agissait comme cela à cause d´une vérité terrifiante. Il vivait dans le mensonge, et il ne découvrit jamais son véritable passé. Même en ayant pris connaissance des notes de Gast, Sephiroth vivait dans une fausse vérité. Jenova n´était pas une Cetra, mais une extra-terrestre que les Anciens nommèrent "la crise du ciel". Ce fut Jenova qui infecta la race des Cetra grâce à un virus mortel et qui l´élimina presque complètement de la surface, jusqu´a ce que quelques survivants réussirent à enfermer Jenova dans une strate. Mais Jenova fut trouvée plus tard par la Shinra, et fut accidentellement identité comme une Cetra. Jenova n´était pas la mère de Sephiroth, pas plus que Hojo le "produise". Sephiroth était en réalité le fils de Hojo, et de Lucretia, l´amour secret de Vincent. Hojo, dans le but de prouver la théorie de la réunion de Jenova, proposa son propre fils pour effectuer le projet Jenova, alors q´il était encore dans le ventre de sa mère.
On peut dire que Cloud et Sephiroth étaient, dans un sens, les enfants de Jenova, et des frères. Quand Cloud réussit à trouver sa propre indenté, Sephiroth avait déjà perdu la sienne, et répandait sa vengeance à travers le monde. En fait, on ne peut que se sentir désolé pour ce personnage. Sephiroth était un enfant normal, mais qui fut forcé à vivre dans les rêves d´un autre, avec une identité fausse. Vivant une vie q´il n´avait pas choisie avec des pouvoirs surnaturels monstrueux qui le rendrons bientôt fou, Sephiroth est lui aussi un personnage tragique, tout comme Aeris, mais qui elle pouvait au moins contrôler sa vie.
