Dans System Shock 2, le joueur doit lutter contre un virus génétique à bord d'un vaisseau spatial en 2114. Cette suite reprend les bases du premier épisode et vous propose un mélange de jeu de tir et d'aventure sur PC. Vous pourrez aussi faire évoluer votre personnage en lui affectant différents attributs à la manière d'un jeu de rôle.