Encré dans l'année 2666, le jeu d'action Aquanox sur PC plonge le joueur dans un monde sous-marin tout en 3D, la surface habitable terrestre étant quasiment dévastée. A bord de votre vaisseau et aidé par votre bande de mercenaires, vous devrez lutter contre des terroristes qui ont mis la main sur du matériel scientifique dangereux. Ainsi vous allez combattre diverses créatures tout au long des différentes missions.