Mario Clash sur Gameboy est un jeu de plates-formes quelque peu différent de ses prédécesseurs puisqu'on retrouve notre plombier dans des univers en différents plans ce qui nous donne l'illusion de la 3D. Une grande première sur une console portable. L'objectif du jeu est de dégommer tous les ennemis à l'écran grâce notamment aux carapaces des Koopas.