Après les nombreuses plaintes de joueurs à Tomb Raider 2 sur Playstation quiregrettaient de ne pas pouvoir sauvegarder à n'importe quel moment, Eidos a réagi etannonce que Tomb Raider 3 aura un tout nouveau système. Selon le niveau de difficulté,soit le joueur utilisera le vieux système des cristaux (niveau difficile), soit il pourrasauvegarder n'importe quand (niveau normal).