Dans ce nouvel opus de la saga Atelier disponible sur PS3, vous incarnez Sophie Neuenmuller, tenant un magasin d'Alchimie près de la ville de Kirhen Bell. Un livre offert pas sa grand-mère se révèle être capable de prendre une apparence humaine et devient son professeur. Sophie doit aider son professeur à retrouver la mémoire en écrivant en son sein toutes les recettes d'alchimie qu'elle découvre, et ce en récoltant des ressources prises sur des monstres que vous devrez combattre.