Directement inspiré du jeu télévisé, Fort Boyard : Le Jeu sur PC réserve plusieurs dizaines d'épreuves, où il faut s'adapter à chaque fois à un défi spécifique. Chaque épreuve est à réaliser en temps limité et nécessite d'envoyer le membre de l'équipe le plus adapté à l'épreuve. Une fois dans la cellule, le joueur gère directement son candidat, pour lui faire libérer la clé alors que le temps s'écoule inexorablement : trop de faux pas et la porte se referme sur le prisonnier !