Aquanox Deep Descent est un jeu de tir sous-marin à la première personne. Au cœur du monde dystopique d'Aqua, le joueur prend le contrôle de vaisseaux sous-marin pour livrer des batailles aquatiques. Aqua est en fait un réseau de colonies dans lequel de nombreuses factions livrent un combat pour la conquête des profondeurs.