Phoenix 3 sur 3DO est un jeu d'action qui comprend deux phases à la jouabilité bien différente. La première moitié du jeu se présente comme un jeu d'action traditionnel tandis que la deuxième moitié propose un jeu de combat spatial en 3D. L'histoire se déroule sur la planète Galearth, menacée par les extraterrestres nommés Gral. Le joueur incarne Derek Freeman qui doit trouver une arme capable de contrer les Gral. Des scènes cinématiques filmés parsèment le jeu.