Evidemment, mais les créneaux horaires sont très orientés : le matin, c'est pour les enfants, le soir, pour la famille, la nuit, pour les adultes.
Après, un animé comme One Piece qui est beaucoup moins populaire auprès des enfants que Pokémon (20% contre 12-13%) ou Doraemon, Shin-Chan ou Sazae-san (près de 30%) est quand même diffusé le matin parce que son audience générale est bonne.
De toute façon, il faut savoir que lorsque les animés mainstream sont concernés (et c'est le cas de Hunter x Hunter), ce n'est pas la censure qui fera partir le téléspectateur (ou alors une frange minoritaire). D'abord parce que beaucoup ne lisent pas le manga, ensuite parce que d'autres se fichent de la censure (des animés comme One Piece, Toriko ou Detective Conan sont partiellement censurés et ont de bonnes audiences).
Bref, il faudra attendre de voir les ventes des DVD. De bonnes ventes peuvent tout à fait compenser des audiences moyennes (voir Bleach qui a des audiences merdiques mais des DVD qui se vendent extrêmement bien pour un shônen qui dure des centaines et des centaines d'épisodes).