Selon le site http://www.ultimetalgear.com , les boss représenteraient les émotions que Snake doit absolument controler / métriser pour finir sa mission... En l´occurance tuer son mentor, la personne a qui il tient le plus : The Boss. =)
En les tuant, il surmonte une à une les émotions représentatives de chaque boss.
Il doit surmonter la peur (The Fear), la douleur (pain), la tristesse (The Sorrow). Il doit pouvoir assumer la fin (The End) et faire preuve de violence (the Fury).
Puis, ayant tué The Boss, il doit pouvoir assumer un dernier sentiment : la joie (The Joy, le nom de code de The Boss). Difficile pour lui me direz-vous, d´ailleurs il n´y arrivera pas et se révoltera par la suite contre le monde entier. =)