Il y a longtemps de ça, la planète Zebes était occupée par le peuple Chozo, un peuple très avancé mais pacifique. Quelques humains vivaient également la bas, dont Samus Aran qui y vécue les premières années de vie. Mais un jour, les pirates de l’espace prirent par la force le contrôle de la planète pour y créer leur base d’opération. La plupart des habitants perdirent leur vie ce jour la, sauf quelques chanceux qui réussirent à s’enfuir. Samus fit partie de ces gens la, mais pas ces parents. Elle jura alors de se venger.
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