1. Des provinces peuvent devenir indépendantes, mais sous forme de rebelles (tu sais ce que sont les différences entre les factions rebelles et les factions normales ?) . Par contre, les rebelles ne peuvent pas devenir une vraie faction. Par contre, quelque fois dans le jeu, à certaines dates, apparaissent de nouvelles vraies factions (comme les suisses ou la golden horde pour la early period) qui peuvent s´emparer, lors de leur apparition, d´une ou plusieurs de vos provinces... Si tu leur laisse, avant qu´ils en prennent possession, la province libre de toute armée, ils vont s´y installer sans vous déclarer la guerre.
3. Bien sûr, les siciliens, les italiens, les byzantins et les almohades sont ceux le plus susceptibles de l´attaquer (à cause de leur tendance à l´expansion). Même la papauté peut décider (plus rarement) d´attaquer ses voisins.
4. Les alliés servent à vous aider dans les guerres contre les ennemis communs, à vous protéger, à vous garantir une certaine assurance (on n´est effectivement pas obligés de garder des garnisons près des frontières alliées...).
5. Cela peut se faire uniquement si vous vous alliez contre un ennemi de votre allié, ce qui va rompre votre actuelle alliance sans déclarer la guerre. Autrement, vous pouvez envahir ses provinces, mais ça en fera un ennemi.
Pour tes dernières questions, je te conseille de voir les différents topics à ce sujet... 