Tu ne formates pas tes disques dur comme il faut !
Donc je récapitule :
T'as tous les fichiers sauvegardés sur un dd externe donc t'es tranquil de ce côté là.
Branche tes deux disques dur interne C et Z et met ta clé usb bootable. C'est à partir de l'écran d'accueil d'installation de windows que tu pourras formaté tes deux disques durs.
je parle de ça http://wolfaryx.fr/wp-content/uploads/wlm/Installer-Windows-dans-un-disque-dur-vir_BE09/installation-windows7-selection-disques.png
Si tu dis que ton message d'erreur intervient avant que tu ne parvienne jusqu'ici, c'est qu'il y a une merde avec ta clé bootable. Essaie avec une clé plus grosse ou un dvd.
Une fois que t'es arrivé sur l'image que j'ai mise plus haut, formate tout, supprime tout. Et installe windows sur le disque dur que tu veux, les deux seront vierges.
Le fait que ton pc te propose deux windows prouvent que tes disque durs ne sont pas formatés, il faut à l'écran des choix de disque dur a l'installation de windows.