Chez les mammifères, l´ouverture externe du vagin se trouve dans la vulve, en arrière de l´orifice de l´urètre (méat urinaire). Une membrane, l´hymen, se trouve dans plusieurs espèces de mammifères dont les humains. L´hymen clôt le vagin partiellement de la naissance jusqu´à ce qu´il soit rompu ; ceci peut avoir lieu soit par le premier coït, soit par un autre incident comme un examen médical, une blessure, des exercices sportifs intensifs, l´introduction d´un objet, etc.
Le vagin a plusieurs fonctions biologiques :
* Le plaisir sexué ;
* l´évacuation des règles dans les espèces qui en ont ;
* la facilitation de l´accouplement par la lubrification des parois du vagin notamment grâce aux sécrétions des glandes de Bartholin ;
* l´admission du pénis lors du coït, et l´introduction ainsi du sperme (qui contient les spermatozoïdes) pour assurer la fusion des deux gamètes avec l´ovule ;
* la sortie de l´enfant de l´utérus à la fin de la gestation, afin qu´il puisse commencer sa vie hors du corps de la mère (l´accouchement chez l´être humain, la mise bas chez les animaux). L´ensemble de structures permettant la sortie de l´enfant s´appelle la filière pelvigénitale
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