Mon hypothese perso :
Le marchand était un de ceux sur qui les plagas ont été testés en premier, Luis s´en occupait à ce moment là, il fut le cobaye pour voir si les plagas pouvaient être controlés (Saddler voulant s´en assurer avant de se faire lui-même infecté) et voir s´ils peuvent être retirés si besoin est... Il gardera le parasite en lui tout en gardant le controle, à l´aide de medicaments données par Luis.
Ensuite, Luis et Pedro (c´est un nom que je lui donne au hasard, avant qu´il devienne "le marchand") commencent à découvrir les véritables plans de Saddler et essayent de les contrecarrer comme ils peuvent. Pedro cache toutes les armes qu´il peut trouver afin de diminuer la puissance offensive de l´armée que forme Saddler pendant que Luis va travailler sur un antidote et s´emparer de l´échantillon original. Tout deux utiliseront les tunnels secrets pour se déplacer sans être vus, jusqu´à ce que Luis se finisse par se faire capturer, leur plan pour contrer Saddler devient alors de plus en plus difficile.
Avec l´arrivée de Léon, l´espoir renait et Pedro voit en lui celui qui pourra battre Saddler et stopper toute cette folie, il décide donc d´aider l´américain en lui vendant les armes qu´il a volé (ne pouvant les lui offrir, afin d´éviter d´être demasqué trop rapidement par les ganados, et puis il doit survivre lui aussi !)
PS : Un autre détail aussi, en mode difficile, on peut dire qu´il n´y a qu´un seul marchand (si on le tue, tous les autres disparaissent)