Au pire il y a Pipelight.
http://fds-team.de/cms/pipelight-installation.html
Ça utilise Wine pour faire tourner le binaire Windows de Flash (qui est à la dernière version). Le truc, c'est que Wine n'est utilisé que comme un tunnel qui permet d'exécuter la base du binaire, le rendu visuel lui est effectué en natif, donc c'est plutôt performant.
Ça supporte aussi Silverlight et d'autres runtimes assez communs.
Perso je m'en sers pour les sites qui ont réellement besoin de Flash (même si j'essaye de maximiser l'utilisation du HTML5 sur les sites qui le supportent) et c'est vraiment sympa, surtout avec les services qui gèrent mal ou pas du tout le Flash natif de Linux, comme Dailymotion.