Tu perds ton temps et ta santé mentale.
1) on ne s'avance pas sur un cours parce que ça fait chier tout le monde :
les profs qui ne t'apprennent rien,
toi parce que tu n'as rien à faire en cours,
tes camarades que tu vas embêter pour t'occuper.
2) C'est pas parce que ton (futur ?) IUT a des machines sous CentOS que tu es obligé d'adhérer à ce choix. Mon université à ces machines sous Ubuntu, c'est pas pour autant que j'ai ubuntu chez moi !
Par ailleurs, il est fréquent quand on travaille sous Linux de le faire à distance, notamment via ssh. À la limite, tu pourrais faire tout ton boulot sous Windows en te connectant via Putty (le soft windows qui fait du ssh) à ton IUT.