De quel dossier parles-tu ?
Normalement, tu n'as pas à faire ce genre de choses. S'il s'agit d'un truc additionnel pour xine, vérifie avant toute autre chose que ce n'est pas fourni par un paquet ubuntu.
Sinon, si tu veux copier en mode graphique, lance konqueror en root (c'est pas top niveau sécurité mais bon...) :
"sudo konqueror" depuis un terminal, et si tu veux te passer complètement d'un terminal, crée un lanceur avec cette même commande.