Désolé d'avoir oublié ce topic mais un excellent tuto a été mis en ligne sur ubuntu-fr pour régler le problème. D'ailleurs il ne sert pas qu'à régler le probleme et comporte certaines options intéressantes pour bien utiliser le laptop-mode et économiser de l'énergie.
Tout se trouve ici :
http://doc.ubuntu-fr.org/laptop_mode
et plus particulièrement ici :
http://doc.ubuntu-fr.org/laptop_mode#correction_du_probleme
Depuis que j'ai suivi le tuto ma tete de DD se parque très rarement lorsque je suis sur secteur.
En batterie, elle se parque assez souvent mais ça c'est un réglage voulu, cela économise l'énergie et évite le plus possibles les pertes de données lorsque le DD subit un choc.
Le but est de bien configurer le laptop_mode et que celui-ci soit actif en batterie et inactif sur secteur. Je n'ai plus de problème dessus et j'ai même réussi à gagner un peu en autonomie grâce à quelques astuces qui expliquent comment éviter que Ext3 ne réveille trop souvent le DD sur batterie.