Parce que Walt pose trop de problèmes et que Gus n'a plus besoin de lui : il a Jesse maintenant.
En fait, c'est à cause de ce que Walt a dit à Hank lors du dîner qu'il se retrouve dans cette merde à la fin de cet épisode. Hank aurait arrêté son enquête et Gus n'aurait pas eu besoin de le tuer. Bon, ça n'empêchera pas le fait que Gus veuille le tuer mais au moins, ça lui aurait fait gagner du temps.