Est ce que c'est juste la toute fin que tu n'as pas compris? En gros pour reprendre au niveau de l'immolation du père Martin, il te dit qu'il a réparé l'ascenseur et que tu pourras finalement sortir des lieux sauf qu'il te piège et qu'il t'emmène tout droit vers le complexe souterrain. Il me semble qu'il n'y a pas de réelle explication sur le fait que le père Martin fasse ça. Personnellement je trouve cela bizarre qu'il te guide pendant tout le jeu pour finalement te tendre un piège. Quelles sont ses intentions? Est ce qu'il connait même l'existence de Billy et du Dr. Wernicke et de leur lien avec le Walrider? La connotation religieuse du perso laisse penser que non mais dans ce cas on ne comprend pas pourquoi il t'emmène dans le labo...bref.
Dans le complexe souterrain, tu es poursuivit par le Walrider, qui tue ensuite Chris Walker avant que celui-ci ne s'en prenne vraiment à toi. Là encore il n'y a pas d'explication, vu que le Walrider a décimé des Variants et des membres des forces spéciales et qu'il te traque à la fin du jeu, on ne sait pas pourquoi il s'en prend à Chris Walker plus qu'à toi.
Ensuite tu tombes sur le Dr. Wernicke, qui se révèle être bien vivant contrairement à ce que laisse penser les documents et les paroles de certains Variants. Tu apprends que le Walrider est une entité qui est apparut suite aux expériences nanotechnologiques qui ont eu lieu dans l'asile, sur la personne de Billy. C'est ce Billy qui contrôle le Walrider, et pour de détruire ce dernier Wernicke t'explique que tu dois tuer Billy. Une fois que tu as réussi, le Walrider possède ton corps (il réussi à cause de toutes les horreurs que tu as vu durant ton passage dans l'asile, condition indispensable) et quand tu arrives à la sortie, tu tombes sur Wernicke et de nouveau membres des forces spéciales qui te tirent dessus.
Après pour la fin du personnage, si tu fais quelques recherches tu verras qu'il y a deux versions: ceux qui pensent que Miles est mort, et ceux qui pensent qu'il est vivant car le Walrider te permet d'avoir une forte capacité de régénération (pour cela que Wernicke est toujours en vie). A toi de te faire ta propre opinion, du moins jusqu'en avril avec la sortie du DLC qui devrait nous en apprendre plus sur ce qui s'est passé. Vu ce qu'on entend, on peut penser que les forces spéciales ont été décimées, mais pour Miles et Wernicke mystère. Sachant que pour ce dernier, c'est Billy qui décidait de le garder en vie, avec Billy mort, je suppose que le Walrider devient une entité capable de prendre ses propres décisions et de choisir d'épargner ou non quelqu'un...
Enfin voilà, comme tu peux le voir il y a encore des points d'ombres. Après il y a peut-être des choses que j'ai manqué, dans ce cas d'autres membres pourront t'éclairer.