Si j'etais le scenariste de Prototype 3 je ferrais ca ainsi:
Pariah arrive et il a une force colossale, bien au dela de celle de Heller ou Mercer, le Blackwatch fout le pays en quarantaine et instaure la loin martiale avec toutes les derives.
Mercer qui savait que Pariah venait a laissé Heller "murir" pour le bouffer de l'interieur et prendre toute sa puissance pour accumuler la sienne et celle de Heller ensemble.
Mercer ce serait juste servi de Heller comme d'une sorte d'oeuf qui accumulait de la puissance, et s'en servir pour lui ensuite.
Mais l'idée de Flodu13 est pas mal non plus de faire une sorte de double personnalité et 2 avatars transformables du point de vu du gameplay.
Mais Mercer est bien trop badass et a trop de fans pour mourir comme ca a la fin de P2, moi je n'y crois pas.