Les Anciens ne sont pas comme Junon ou Minerve.
Le Sujet 16 est mort. Ce que rencontre Desmond au coeur de l'Animus n'est qu'un programme informatique crée par 16. Une sorte d'IA qui contient toutes la personnalité et la mémoire du Sujet 16. Malgré les apparences, ce n'est pas le Sujet 16 a qui Desmond parle mais son héritage...
Les Anciens, eux, existent toujours. Ce sont plus que des projections holographiques. Le simple fait qu'ils interagissent avec le monde réel prouve qu'ils ne sont pas éteints.
16 n'interagit plus que dans l'Animus (et encore...)
Quand aux Anciens, il est vrai que la vidéo prouve que les Anciens sont malveillants cependant les Assassins n'existent presque plus et ils n'ont plus aucun allié... entre les Templiers et les Anciens, ils ont choisis ce qui leur apparaissaient comme le moindre mal.