Mais, Samus Aran à été accueillie par les Chozos après l'attaque de la colonie par l'armée de Ridley, où elle vivait avec ses parents, elle avait trois-quatre ans à l'époque, les chozos l'on éduqué sur Zèbes, a son arrivé elle rencontre déjà Mother brain dans son bocal. à l'adolescence, elle reçois la power suit que les chozos on crée uniquement pour elle, après qu'elle reçue son armure, la planète Zèbes fue attaqué par Ridley, pour la deuxième fois Samus le rencontre. Suite à l'attaque des pirates de l'espace, elle s'engage dans la fédération galactique où elle rencontra le général Adam Malkovich, cité dans metroid Other M et Fusion, il représentait pour Samus une figure paternel, il connait parfaitement Samus et réciproquement, après un événement qui marque un tournant dans sa vie, peut etre la mort du frère d'Adam, elle a quitté la FG pour s'engagé en tant que chasseuse de prime, sa première mission(donné par la FG) était de se rentre sur Zèbes pour y détruire Mother brain, qui a été "reprogrammé" par les pirates et qui est devenu leur chef, rappelons que Mother brain contrôle les métroides de la planète zebes. Apres la destruction de tourian, Samus quitte Zèbes et décide de se rentre sur SRX388 pour y détruire l'espèce Metroide,(entre temps se produise les événement sur Talon V, la galaxie alambique, Ether et Phaaze)à la fin de sa mission, elle y receuille une larve et l'amène sur une station spaciale proche de Zèbes, Ridley vole le Metroide et Samus le poursuit dans les profondeur de Zèbes(Norfair), Samus découvre la capsule où était retenu le bébé brisé elle se rend donc dans Tourian reconstitué où elle affronte mother brain et là commence Metroid other M ... le peuple Chozo s'est éteint apres l'attaque sur Zebes (apparament il ne restais qu'eux)
