J'ai remis à jour mon idée 
Quelques changements au niveau de dialogues qu'on pourrait avoir, ainsi que de la fin
Après que Shepard en ait terminé sur le Conseil, l'Amiral Hackett contacte Shep pour l'informer de la situation de Terra Nova et lui dire qu'un de leur scientifique est encore là-bas et a besoin d'aide.
Arrivés à Terra Nova, Shepard découvre le scientifique en train de tuer un zombi qui attaquait les survivants. S'ensuit une mission de recrutement où on doit le poursuivre, étant donné qu'il nous prend pour un ennemi.
Une fois récupéré, on devra attaquer une base que les Moissonneurs auraient prise d'assaut et qui contiendraient des infos intéressantes. Assaut au cours duquel le personnage sera blessé.
Il sera ramené à bord du Normandy, où IDA découvrira quelque chose de surprenant : C'est une plateforme mobile de Moissonneur. Une fois que Dan est soigné (ou réparé), il explique à Shepard qu'il se range de leur côté en se montrant pacifique. (On ne pourra cependant l'avoir dans notre commando qu'après la mission de Palaven, car c'est à ce moment là où on découvrira la véritable identité du nouveau personnage.)
On aura accès à de nombreuses dialogues avec lui.
- Un dialogue où on demande à en savoir plus (comment les Moissonneurs ont été créés, leurs motivations) mais il ne se souvient plus de rien, à part les cycles de sa vie synthétique, son vaisseau ayant été détruit. Il explique que sa mémoire a été affecté par son apparence organique.
- Le second dialogue suit le précédant. Shepard demande à savoir comment "Dan" a été tué. On apprend qu'il a été trahi par l'Augure car ils n'étaient pas sur une même longueur d'onde. Celui-ci aurait programmé un canon électo-magnétique dirigé sur notre Moissonneur. On apprend alors qu'il est en réalité le Moissonneur qu'on a visité dans ME2 et qu'il était le premier Moissonneur. Cependant, il ne se souvient plus des différents qu'il avait eu avec l'Augure.
- Un dialogue où il demandera si IDA est "célibataire" et où il expliquera ses nombreuses expériences sexuelles avec les différentes races du cycle présent.
- Un dialogue où Dan parlera de Sovereign. Celui-ci va même le traiter d'abruti, d'IV limitée en terme "Synthétique". Il le décrit comme quelqu'un d'impulsif, de fou-furieux. Il dit même que son regard a croisé celui de Sovereign lors de la bataille de la Citadelle.
- Un dialogue où il parlera de Saren et dit qu'il le connaissait plutôt bien et avait même tenté de le sauver de l'endoctrinement. Il citera également le nom de Jack Harper.
- Un dialogue, où, si nos cicatrices se voient trop, nous explique que les implants sont issus de technologie Moissonneur et avoue avoir été "un fournisseur particulier de Cerberus" lors de leur lutte contre les Récolteurs et un peu avant.
Il y aura également des dialogues entre les différents de l'équipage :
Garrus : - Il parle de calibrer certaines choses et avoue ne pas avoir testé de Turien "en action".
Tali : -Il propose à Tali de lui laisser un peu de "chocolat Turien"
IDA : - Il fait des propositions à IDA sous le nez de Joker qui coupe la communication lorsqu'il a compris les intentions du Moissonneur.
Liara : - Il dit que lui et le Courtier de l'Ombre étaient de vieux amis, c'est d'ailleurs lui qui l'aurait informé de l'arrivée des Moissonneurs.
James : - Il lui fait une remarque sur le concours N7 et parie tout ses crédits que le jeune homme échouera au test de QI.
Javik : - Il semble féliciter le prothéen de sa survie.
Légion : - Il lui demandera s'il est "disponible".
Après, les autres, j'ai pas d'idée
Mis à part ça, dès qu'il arrivent pour chercher les diplomates quariens, Nous aurons un dialogue au cours duquel Dan parle du soleil d'Haestrom et dit se souvenir de ce soleil. Il semblait se rappeler de quelque chose à son sujet. Ce n'est que lorsque Tali mentionne l'énergie Noire que le Moissonneur entre dans une cogitation pénible.
(Et là, je vais me baser sur le script original.)
Ensuite, une mission avant l'attaque du QG de Cerberus. Ilos.
Dan dit que la clé des mystères se trouve ici.
Là-bas, ils rencontrent Vigil qui fait des révélations (cf script original) sur l'énergie noire, son expansion dangereuse. Ainsi, Dan se souvient de tout nous fait alors part de nombreuses révélations : Il a été créé par une race organique... Les veilleurs ! Qui l'avaient baptisés "Alpha"
Cependant, il avait découvert les dangers de l'Energie Noire grâce à une seconde IA, l'Augure, plus jeune que lui. Ensemble, ils exterminent leurs créateurs qui semblaient ne pas comprendre pourquoi leurs deux IA perfectionnées détournaient des vaisseaux et "terrorisaient" (comme dans Overlord avec le témoignage du scientifique qui dit que l'IV ferme des portes et en ouvre d'autres comme s'il voulait les mener quelque part) les scientifiques dans le but de leur montrer les problèmes d'énergies noires.
Avec les corps de leur créateur, ils créèrent un vaisseau pour chacun d'eux. Ils copient cependant le code génétique des Veilleurs car l'entretien de la Citadelle était impossible pour les deux Moissonneurs, afin que ceux-ci gardent la Citadelle. Au cours des années, ils moissonnent les autres races afin d'acquérir des compétences organiques nécessaire à l'étude de l'énergie Noire. Puis un jour, Alpha et l'Augure se confrontent. Alpha dit que le meilleur moyen d'arrêter l'énergie noire est de la contrôler, de la réguler. Mais l'Augure pense plutôt à l'anéantir tout en évitant un impact néfaste sur l'univers. Les Moissonneurs se divisent en deux groupes. (Même schéma que Saren/Homme Trouble VS Shepard/Anderson/Hackett)
C'est alors que l'Augure utilise un canon électro-magnétique pour tuer son ainé. Ceux qui le soutenaient durent rejoindre l'Augure pour éviter d'être détruits par celui-ci. Ceux qui résistaient étaient exterminés (cf la carcasse d'un Moissonneur énoncée dans la description d'une des planètes de ME1 ou ME2 où on dit avoir retrouvé une sorte de vaisseau géant dans l'atmosphère.)
S'ensuit alors la découverte d'un vaisseau Moissonneur gigantesque, sur lequel les Prothéens avaient travaillés. Dan décide de s'en emparer, mais c'est à vous de choisir. A noter que accepter le vaisseau apporte pas mal de War assets ( )
La fin change du tout au tout. Lorsque l'Augure attaque Shepard pour aller au rayon, Alpha arrive et un combat titanesque s'engage entre eux. Les critères de survie d'Alpha dépendent de nombreux choix, effectués dans les trois opus (sauvegarde base des Récolteurs par exemple).
Quand on arrive devant le Catalyst et qu'il dit son explication illogique, Shepard mentionne l'Energie noire, ce qui surprend le Catalyst qui se retourne en disant un truc dans le genre "Alors... Vous comprenez notre problème ?"
Là, une projection d'Alpha et de l'Augure apparaissent. Les trois "Moissonneurs" essaient alors de convaincre Shepard de choisir leur solution.
Celle du Catalyst est celle de la Synthèse, qui se rapproche de Saren.
Celle d'Alpha est le Contrôle, qu'on accorde au Moissonneur, afin qu'il ramène ses "fils" à la raison. (Homme Trouble)
Celle de l'Augure est de "rester en dehors de ça" (Ne rien faire/Partir)
Celle d'Anderson/Shepard, la destruction.
Après, quelques points sont à affiner.