Sinon le New NMM permet de virtualisé aussi a la manière de MO je crois.
Tu peu y accéder au launcher en rajoutant dans Fallout4Prefs.ini :
[Launcher]
bEnableFileSelection=1
Il faut cliquer ici ensuite :

Cependant j'ai testé et ça retire le Fallout.esm de la liste des plugins donc je ne sais pas si ça fonctionne correctement une fois en jeux, j'ai continuer a la main du coup perso.
Apres il suffit de te faire un raccourci vers le dossier ou tu a le .txt, le seul truc chiant c’est de passer le fichier en lecture seul après chaque modif, sinon tu a des gestionnaire qui te permette de gerer ça mais je ne crois pas que ce soit le cas pour NMM encore.