Bah finis le jeu mais bon normalement cela est expliqué au début. Encore un qui n'a rien écouté durant le jeu
En gros tu incarnes Desmond qui fait partie de la confrérie des Assassins. Tu as été capturé par Abstergo (les Templiers). Le Dr. Warren Vidic travaille sur le projet Animus (la machine) qui permet de revivre, grâce à la génétique, les mémoires des ancêtres de Desmond. Dans cet opus tu revis les mémoires de l'assassin Altaïr, en Terre Sainte en 1191.
Les Templiers (Abstergo) cherchent à localiser un artefact en passant par les mémoires d'Altaïr.
En gros voilà le scénario 