Les mongols étaient païens à la base. Mais en tant qu'envahisseurs, ils étaient assez peu représentés dans la population et ont souvent adopté les us des contrées conquises.
Au moyen Orient, ils se sont rapprochés de l'Islam (sans l'adopter pour autant). En Asie ils se sont carrément convertis au bouddhisme (j'ai un petit doute mais il me semble que c'était plus politique qu'autre chose. si tu es curieux, wikipedia t'en dira plus ^^)
Je pense que les développeurs ne les ont pas fait païens pour ne pas avoir à gérer les bâtiments païens. Ilaurait fallu en designer des différents de ceux des aztèques, alors qu'ils ont le même intitulé de religion. Je comprends qu'ils aient pas voulu se prendre la tête ^^