Il faut effacer le fichier SETTINGS.CFG qui se trouve dans :
Vista :
C:\Users\[NomUtilisateur]\AppData\Local\Rockstar Games\GTA IV\Settings\
XP :
C:\Documents and Settings\[NomUtilisateur]\Local\Application Data\Rockstar Games\GTA IV\Settings\
Le mieux est d'effacer tous les fichiers pour être sûr.
Ensuite tu lance le jeu une première fois, pour recréer les fichiers. Et au second lancement, tout rentrera dans l'ordre si ton commandline.txt est correct et bien placé.
(Attention certains de ces fichiers/dossiers sont cachés, il faut cocher une option pour les voir)