Le manque d'informations au sujet des Moissonneurs dans le 1er volet de Mass Effect ne nous permet tout simplement pas de proposer une hypothèse sur le pourquoi du comment, je pense qu'il faut se contenter du "leurs actes dépassent notre entendement".
Ce qui est d'ailleurs probable, imaginez la différence de perspective entre une entité synthétique d'une durée de vie potentiellement illimitée, et une entité biologique mortelle, elle peut être si fondamentalement dissemblable et éloignée qu'elle ne permet pas de comprendre leur raisonnement.
Ce qui me perturbe est ce que dit l'IV sur la fin des prothéens, que les Moissonneurs ont pillé leur technologie, d'ailleurs il semblerait que les Moissonneurs n'ont pas évolués depuis le dernier cycle, c'est quand même curieux pour une entité d'une intelligence supérieure qui devrait suivre une progression exponentielle. Peut-être que pour une raison obscure ils sont dans l'incapacité de poursuivre leur évolution par eux-même, et vont donc "moissonner" un peu d'une façon parasitaire la technologie d'autres civilisations avant des les supprimer impitoyablement. C'est un processus très lent mais le temps n'est pas un facteur d'une véritable importance pour eux, ça expliquerait pourquoi en une période si longue ils n'ont pas acquis et dévelloppé une supériorité technologique écrasante.
On peut se demander egalement pourquoi le Thorien a été épargné lors du cycle précédent (quelle plaie de devoir le supprimer sans pouvoir apprendre plus d'informations sur lui...) c'est une entité organique excessivement intelligente mais qui est semble-t-il dépourvue d'intérêt pour un quelconque développement technologique, donc n'intéressait pas les Moissonneurs qui n'auraient finalement pas une haine viscérale des entités organiques comme les geths.
Dans une autre optique nous pouvons même imaginer que les Moissonneurs sont des sortes de gardiens, qu'une civilisation intelligente fini immanquablement par développer une technologie aux conséquences cataclysmiques lors de son évolution, son élimination avant ce stade serait donc un mal pour un bien, une nécessité afin de préserver le reste de la galaxie.
Enfin on peut imaginer tout et n'importe quoi, mieux vaut attendre une suite pour en savoir plus^^