Il est dit que celui qui recherche le trésor légendaire et qui possède la carte ne peut être que le brave dont parlent les récits. Le fait est que Mario a tout du parfait héros puisque sa détermination et son courage lui permettent de surmonter les pièges les plus vicieux tendus par ses ennemis. C'est donc à juste titre que Mario revendique le rôle principal de cette gigantesque comédie qui, comme vous allez le voir, possède bon nombre de caractéristiques théâtrales qui en font un spectacle constellé d'humour. L'essentiel de chaque chapitre est donc relatif aux aventures de Mario, que l'on contrôle tout au long du jeu et qui voit ses capacités augmenter au fur et à mesure de ses gains d'expérience. Il sera aidé dans sa tâche par divers alliés inattendus qui vous sont présentés un peu plus loin, et dont le rôle s'avère souvent crucial. Si ceux-ci ne gagnent pas d'expérience, il est tout de même possible d'améliorer leur efficacité en collectant des "shines", les soleils de Mario Sunshine. Un seul d'entre eux peut accompagner Mario à la fois, mais il est possible de changer de partenaire à tout moment, même au milieu d'un combat.