Vous commencez comme dans Halo 1 par une séance de remise en forme. Bougez la tête pour regarder les points rouges puis allez dans le rechargeur de bouclier. Après ce test un homme viendra vous chercher, partez avec lui dans l'ascenseur puis dans le vaisseau. (Ça ressemble à Half-life tout ça.) Une fois que le vaisseau s'est arrêté, allez voir vos collègues. (Cinématique) après la cinématique, vous devrez aller chercher une arme, descendez les escaliers à gauche et prenez les armes sur le support vertical. Allez ensuite avec vos camarades pour défendre l'entrée. Des covenants vont débarquer, vous devrez les anéantir et ensuite, passer dans le couloir de droite puis encore à droite pour prendre les escaliers. En haut, prenez la porte et vous verrez à votre gauche des hommes en train de se faire tirer dessus. Sautez et allez les aider puis dirigez-vous au fond à gauche. Montez les escaliers et vous arriverez dans la pièce où les vaisseaux arrivent. Tuez tous les covenants qui débarquent.

Descendez les marches et traversez le couloir. Vous allez arriver dans une zone occupée par les covenants, planquez-vous derrière le bouclier et anéantissez-les tous. Prenez ensuite au fond à gauche, continuez jusqu'à ce que vous trouviez des collègues, et allez les aider à tuer les covenants.

Une fois que vous serez hors du vaisseau, dirigez-vous à droite et tuez l'élite en jet pack puis prenez la porte à droite. Vous allez être accueilli par de nouveaux monstres puis par des covenants par le monte-charge. Allez ensuite sur le monte-charge pour descendre au niveau inférieur. Tuez tous les élites qui se trouvent dehors et prenez à gauche.

Retournez dehors et pulvérisez tout le monde pour ensuite placer la bombe dans l'armurerie et vous envoler avec.