Ayane la jeune ninja part à Venise sous les ordres de Joe Hayabusa. Après la cinématique, vous vous retrouvez encerclé par les ninjas du clan de l'araignée noire. Ayane est rapide et agile, utilisez donc ses aptitudes pour enchainer les combos ensuite les techniques d'anéantissement pour venir à bout de ces ennemis. Utilisez aussi les techniques ultimes et choisissez le combat rapproché pour plus d'efficacité. Passez ensuite le pont situé à droite et ouvrez le coffre. Allez ensuite dans le chemin opposé et traversez un autre pont. Tournez ensuite à droite vers le café et éliminez les ninjas. Ouvrez le coffre et éliminez ensuite les loups-garous en utilisant vos combos. Revenez en arrière et continuez d'avancer pour traverser un autre pont. Tournez à gauche pour trouver un coffre et éliminez les loups-garous qui arrivent. Passez ensuite par la petite porte et avancez jusqu'au bord du canal. Eliminez les ninjas qui arrivent et utilisez vos kunais explosifs contre les archers. Avancez jusqu'au bout de la rive et prenez le contenu du coffre. Traversez ensuite le pont. Montez les marches vers le point de sauvegarde.

Avancez ensuite dans le marché pour rencontrer plusieurs ninjas dont des mages. Utilisez les techniques ultimes ainsi que vos combos pour les éliminer. Avancez ensuite vers la statue de Muramasa et faites vos achats. Avancez vers le cadavre et fouillez-le. Traversez un autre pont et mutilez rapidement les Van Gelf en utilisant les techniques d'Anéantissement. Avancez ensuite vers la statue et sauvegardez votre partie. Traversez ensuite le pont situé à gauche et entrez par la porte.

Dans la cour, vous serez attaqué par de nombreuses vagues d'ennemis. Utilisez les techniques ultimes et les combos pour les mutiler ensuite utilisez les techniques d'Anéantissement pour les finir. Si plusieurs ennemis vous encerclent utilisez votre ninpo qui en éliminera plus d'un et blessera les autres. Restez toujours mobile et utilisez les déplacements rapides pour ne pas rester entre les ennemis.

Boss : Obaba

Après les ninjas, la sorcière du clan de l'araignée noire passe à l'attaque. Ne restez pas en face d'elle sinon elle vous attrapera et vous projettera ou vous mordra. Votre cible est son ventre qui abrite l'oeil du dragon. Esquivez alors ses attaques en essayant de s'approcher d'elle et lancez vos combos sur son ventre. Quand elle saute dans les airs, utilisez les déplacements rapides pour ne pas finir écrasé sous son le poids de corps. Eloignez-vous d'elle quand elle déclenche son attaque en hélicoptère ensuite revenez à l'assaut. Suivez Obaba dans ses mouvements dans la cour en utilisant vos déplacements rapides pour parer des éventuelles attaques du boss. Continuez de défoncer le ventre de la sorcière jusqu'à son explosion.