Adressez-vous aux différents protagonistes à bord du Maelstrom et sur le pont, puis montez à la vigie pour parler à Monell. Redescendez ensuite dans la cale après la scène pour entamer la récupération du vaisseau ancien, puis réglez son compte au Roi lysaat tueur qui jaillit de la porte.
Enfoncez-vous dans les profondeurs du vaisseau en éliminant les créatures qui vous barrent la route, ouvrez les coffres alentours et prenez garde aux sections du sol qui peuvent s'écrouler sous vos pieds, vous laissant en proie aux Lysaat et Crabomards plus bas. Une fois arrivé au Quai de chargement, empruntez le couloir de gauche, traversez la salle de contrôle et allez récupérez un Cyclindre d'éther au bout du couloir suivant en éliminant le Roi crabomard au passage.
Retournez dans la salle de contrôle pour placer le cylindre dans le réservoir et ainsi pouvoir activer les commandes de la grande porte, derrière laquelle vous attend un Aligo megalo : prenez garde à la charge de ce mini-boss, qui vous fera chuter sur son passage, et ne lésinez pas sur l'usage du Grappin pour faire apparaître des fioles de PV. Une fois la créature vaincue, une longue scène vous attend.
De retour aux commandes sur le pont du vaisseau ancien, combattez Malhos en utilisant tout votre arsenal et en déchaînant vos Arts spéciaux dès que possible pour sortir vainqueur de l'affrontement et observez simplement de déroulement des événements pour passer au chapitre suivant.