La molécool est un artefact pisté par la spécialiste à l'aquarium. Cette dernière, qui se trimballe avec un aquarium sur la tête, est en quête des molécools de chaque monde. Une fois que vous avez trouvé cette molécool, allez la voir pour qu'elle active sa machine. Il suffit ensuite de se positionner dans la zone prévue à cet effet pour vous transformer en différentes choses. Cela peut aller d'une plante dans le premier niveau à un camion dans le second. Et bien évidemment, ces transformations vous permettent d'accéder à de nouvelles zones pour trouver encore plus de pagies. On n'arrête pas le progrès !