Après la scène introduisant le personnage de Shelke, qui vous permet à nouveau d'utiliser vos myrages, faites le tour des passerelles extérieure et intérieure pour récupérer 2 Maxi éthers et 2 Magilithes de foudre, puis entrez dans le réacteur mako 0 au centre. Vous aurez ici accès à un portail pour ré-arranger vos formations et utiliser à nouveaux vos myrages classiques si vous le souhaitez. Assurez-vous de garder les capacités Électriser à portée de main et prenez également avec vous un myrager pouvant Voleter.
Retournez ensuite en arrière là où Squall était resté, voletez au dessus du gouffre sur la gauche pour récupérer 2 Maxi éthers, puis défiez le Dragon des brumes qui se trouve un peu plus loin. Vous devrez pour espérer le capturer lui rendre beaucoup de points de vie d'un seul coup, ce qui pourra nécessiter un élixir ou un Méga Soin. En triomphant du combat vous recevrez les Sources régénérantes nécessaires pour la quête « La deuxième requête du marchand ». Récupérez ensuite le Journal intime de fille (extrait n°5) et Enquêtes occultes n°4 sur le côté et retournez dans le réacteur.
Allez chercher les 2 Stabilisants et les 2 Calmants en bas à droite et activez successivement les générateurs 1 et 2 pour débloquer l'accès en bas à gauche. Affrontez ou non la Mimitation sur le gros tuyau en dessous des escaliers après être descendu, voletez sur la gauche dudit tuyau pour atteindre 2 Magilithes de foudre et descendez en bas des escaliers. Activez successivement le générateur de gauche, celui du milieu et celui de droite pour pouvoir activer le terminal et descendez les escaliers après avoir traversé la passerelle.
Faites une halte sur le gros tuyau vers la gauche pour défier trois Géants de mithril de niveau 35 dans la brèche sombre (prévoyez un sort de Bouclier ou de Barrière à leur lancer pour en capturer un) et récupérez le Disque scintillant derrière la brèche (cet item n'est pas obligatoire mais vous servira à accéder à un myrage caché, le Pampa Jumbo). Frottez-vous ou non à la Mimitation qui se fait passer pour un coffre sur la droite, activez dans l'ordre le générateur tout au sud, celui de droite, celui caché sur la gauche et le dernier un peu plus au nord pour pouvoir activer le terminal. Allez récupérer les 2 Rocs barrière en haut à droite, passez sur le gros tuyau pour atteindre le cristal de sauvegarde et activez le terminal.
Ce faisant, vous déclencherez un compte à rebours de 15 minutes, qui ne sera pas mis en pause pendant les combats : passez donc rapidement la porte la plus proche pour retourner dans la première salle, récupérez la Plume de phénix sur le gros tuyau à gauche en passant la porte suivante et refaites le chemin déjà parcouru pour retourner dans la grande salle. Descendez cette fois les escaliers débloqués sur le côté, récupérez 2 Super éthers, et si vous souhaitez vous frotter aux puissants Pampa Jumbo, retournez tout à droite pour passer sur le tuyau et pouvoir donner le Disque scintillant au Golem goulu. Activez le terminal qui suit pour couper le compte à rebours, puis avancez au bout du cul-de-sac qui suit pour faire apparaître les Pampa Jumbo.
Ces ennemis pourront vous infliger de très gros dégâts et disposent de pas moins de 40,000 points de vie. Ils sont vulnérables au Feu et à la Glace, et l'un d'eux peut être capturé en lui assénant plusieurs coups critiques pour activer son halo. Pour suivre le cheminement normal du donjon, au lieu de repartir vers la droite après avoir récupéré les deux super éthers, passez simplement la porte juste à droite et sauvegardez avant d'entrer au cœur du réacteur. Vous y trouver une ribambelle de mages noirs, dont un groupe vous attaque : privilégiez les attaques multicibles pour les éliminer rapidement.
Victorieux, vous obtenez la Clef de la terre ainsi que l'Insigne de Shelke à l'issue de la scène. Récupérez la quête annexe « Le fainéant » auprès du garde sur la droite ainsi que « L'importance d'une tasse de thé (1ère partie) » en allant parler à la femme au sommet du château en empruntant l'entrée centrale, puis sortez enfin direction la Région désertique.