Au début de l’aventure, il vous sera demandé de choisir entre incarner Corvo ou Emily. Si le gameplay ne change pas tellement, c’est surtout au niveau des pouvoirs que la différence se fera ressentir puisque les deux personnages possèdent une palette très différente. Corvo détient à peu près les mêmes pouvoirs que dans le 1 comme la possession d’animaux ou d’humain tandis qu’Emily pourra créer un lien entre plusieurs ennemis. Chaque action sur l’un des ennemis se répercutera sur les autres, ce qui permettra par exemple de neutraliser facilement deux ou trois gardes.