Vous êtes maintenant plongé au coeur de l'action et serez confronté, dans les tunnels du métro, aux premiers ennemis, des agents Wutai déguisés. Pour être au mieux de votre forme, il est utile que lors de ce premier combat, vous commenciez à comprendre les commandes, les touches ainsi que le système de combat. A l'écran des instructions apparaîtront, suivez-les pour attaquer les ennemis qui débarqueront. Le premier boss se trouve dans une autre zone de combat, Zack s'y déplacera automatiquement pour s'y rendre et l'affronter.

Boss : Behemoth

Ce combat vous permet de faire la connaissance de l'Onde Cérébrale Numérique (OCN). Comme le tutoriel l'explique, c'est une sorte de pachinko où, en fonction du résultat, vous obtiendrez divers bonus. Puisque vous n'avez pas moyen de l'influencer, ne vous en souciez pas trop pour le moment. Faites simplement attention aux différents bonus que vous obtenez pour les utiliser, notamment la Transcendence, obtenue lorsque trois images identiques apparaissent. En effet, si vous obtenez un bonus du style "Pas de PM consommé" ou "Pas de PA consommé", c'est le moment d'en profiter pour spammer les magies / les compétences.

Pour venir à bout de cet ennemi, la meilleure technique est de vous déplacer autour de lui et de l'attaquer sans arrêt par derrière. Se placer derrière-lui pour obtenir des coups critiques est clé pour infliger de gros dégâts physiques. De plus, si vous parvenez à infliger un combo entier (5 attaques de suite), vous pourrez l'interrompre pendant ses attaques. Attention cependant, sa queue est la partie de son anatomie la plus dangereuse, faites-y alors très attention. Bloquez les attaques du Behemoth et riposter quand une ouverture le permettra. Si votre santé n'est pas brillante, n'hésitez pas à utiliser des potions. Elles vous redonneront un peu de vie perdue. Très rapidement, vous viendrez au bout de ce monstre. Ce n'est qu'une fois mort que le prologue s'achèvera.