Une fois le boss vaincu, reprenez votre bateau et allez sur l’île des Ruines du futur où vous attend le centre de recherches Chronopolis.

Là, vous assistez à une conversation entre deux fantômes et affrontez, peu de temps après, un robot.

Ramassez ensuite le contenu des coffres et avancez. Là, allez tout en bas à droite pour ouvrir la trappe puis activez le robot nettoyeur. Amenez-le, en passant par l’eau, jusqu’à l’interrupteur en haut à droite de la zone.

Ceci fait, allez à votre tour activer l’interrupteur sur votre droite et continuez jusqu’à l’échelle.

Ouvrez la porte via l’interrupteur sur le bureau et continuez. Dans la salle suivante, allez à gauche et sauvegardez. Revenez sur vos pas et allez à droite. Grimpez l’escalier et entrez dans la porte 2. Vous allez atteindre une salle de contrôle avec un interrupteur à gauche (clignotant). Vous déverrouillez ainsi le niveau 2 de sécurité.

Allez jusqu’à l’ascenseur. Au niveau 3, vous pouvez en apprendre plus sur le monde de Chrono Cross. La suite de la progression se passe au niveau 4. Entrez dans la salle de droite et interagissez avec le dispositif.

Revenez ensuite au premier étage et parlez à l’entité qui se trouve au bout du pont dans la salle du point de sauvegarde.

Retournez ensuite au 4ème étage. Entrez dans la salle de gauche. Affrontez ensuite le robot à gauche pour obtenir une carte magnétique dans le coffre. Activez l’interrupteur sur votre droite.

Vous pouvez maintenant descendre au rez-de-chaussée. Avancez jusqu’à la porte et scannez votre main sur le dispositif. Entrez pour découvrir que Lynx, comme par hasard, est derrière tout ça. Un combat contre lui, doté de 5 000 HP, vous attend. Il est absolument redoutable et il faut sans arrêt se soigner et se munir d’antidotes pour supporter ses attaques et son offensive dévastatrice (un compte-à-rebours se déclenche en cinq phases). Le combat terminé, une longue séquence va se déclencher, détaillant pas à pas les évènements.