Avant chaque run de Legend of Keepers, vous pouvez régler différent sliders de difficulté. Vous pouvez régler la puissance des héros que vous rencontrerez, la quantité d'or que vous trouverez lors de votre run, la vie maximale de votre maître, la motivation que vos monstres récupèreront, ainsi que la durée de la partie. Une partie plus longue vous permettra d'obtenir plus de bonus avant le combat final, et sera donc plus facile.

Plus vous choisissez une run facile, moins votre maître gagnera d'expérience. Trois niveaux de difficulté sont proposés, mais vous pouvez choisir vous même de pousser chacun des sliders.