Vous regagnez le contrôle près du Junks dans le village Machina. Vous pouvez y faire quelques quêtes si ce n'est déjà fait, ou enchaîner directement en parlant à Mikol et en lui répondant " Allons-y ". Vous assistez alors à de nouvelles scènes, pour finalement être de retour sur Mékonis.

Avancez vers le nord et empruntez le couloir à votre droite. Arpentez l'unique chemin accessible et continuez sur la droite en arrivant au Pont de l'apocrypha. En allant sur la gauche et en empruntant le téléporteur au niveau inférieur, vous pouvez déboucher derrière une barrière que vous ne pouviez pas franchir dans l'Usine principale. Avancez vers votre objectif après la scène pour livrer un nouveau combat contre un boss.

Générateur Apocrypha

Cet ennemi n'a rien de spécial hormis sa résistance digne de celle d'un boss et sa capacité à infliger des coups critiques souvent. Certains de ses coups pourront vous faire tomber, mais en menant ce combat sérieusement, vous devriez vous en sortir sans problème dès le niveau 68. Le générateur détruit, Shulk obtient l'Art Cyclone, et vous êtes libre d'enchaîner avec un nouveau combat en empruntant le téléporteur face à vous.

Yaldabaoth

Autant l'annoncer d'emblée, cet affrontement est l'un des plus difficile du jeu (les plus durs restant à venir). Vous ne pourrez toucher votre adversaire au corps-à-corps qu'en étant devant lui, ce qui restreint vos possibilité, et il n'hésitera pas à invoquer différentes variétés de Mékons pour lui venir en aide. Il dispose également de coups pouvant faire chuter tous vos personnages ou les empêcher d'utiliser leurs Arts. La première partie du combat reste relativement simple : concentrez vos assauts sur Yaldabaoth en éliminant les drones qu'il vous envoie, et surtout, en gérant la situation au mieux lorsque les Mékons invoqués sont des Exterminateurs Clock.

Une fois la moitié de sa vie enlevée environ, une vision particulière interviendra. Vous aurez alors deux minutes pour la briser, en détruisant les trois Outils énergie disposés autour du boss. Ne perdez alors pas de temps avec les ennemis invoqués et concentrez-vous sur la destruction de ces tourelles, sous peine d'être trop juste au niveau du temps. La vision brisée, une troisième phase, identique à la première, peut débuter. Et là encore, la chance est votre meilleure alliée : plus Yaldabaoth invoquera d'Offensive Motor, plus vous aurez d'opportunités de lui causer des dégâts. Si les Mékons appelés en renforts sont des Exterminateurs et que la vie du boss est au plus bas, concentrez vos dernières forces sur Yaldabaoth. Vous pourrez ainsi sortir victorieux de cet âpre combat et assister à une cinématique lourde en révélations. La suite : un nouveau combat de boss !