Tout comme les deux précédents, le quatrième patch de Chrono Trigger sur PC vient remanier l'interface du jeu. Cette fois-ci, les développeurs ont modifié l'apparence du menu et de l'écran titre afin d'offrir une expérience plus confortable, que ce soit avec une manette ou un clavier. Il est aussi possible de choisir entre une interface "manette / clavier" et une interface "pavé tactile / souris" depuis les paramètres du menu. D'autres problèmes mineurs ont également été corrigés.

Un cinquième patch est désormais attendu pour la fin juillet. Il ajoutera la possibilité de paramétrer les commandes du jeu à la manette et au clavier / souris.