Lors de ses pérégrinations à travers le métro d'un Moscou post-apocalyptique, Artyom a répondu à des mécaniques de morale dans Metro 2033 et Metro Last Light : ses actions, bonnes ou mauvaises, influaient sur le dénouement de l'aventure. Le système n'en faisait pas des caisses avec de simples indications visuelles à des moments clés, et Metro Exodus restera dans cette optique :

"Nous n'avons pas voulu en faire un jeu où l'on vous propose un scénario qui vous demande littéralement : voulez-vous être gentil ou méchant ?", a commenté le producteur exécutif Jon Bloch. "Nous voulons voir comment les gens jouent, et que le jeu réagisse à cette façon de jouer."

Le titre ira plus loin que ses prédécesseurs, en tenant compte non seulement de nos choix mais aussi de nos actions lors des combats : selon que l'on évite, assomme ou tue nos ennemis, les choses pourraient être différentes pour nous. "Vous aurez ce que vous méritez", a affirmé le directeur créatif Andriy Prokhorov.