Si Ninja Gaiden 3 vous fait de l'oeil, on vient d'en apprendre un peu plus sur son scénario. Ainsi, tout débute par une prise d'otage du premier ministre anglais. Les malandrins n'ont qu'une seule demande : qu'on leur amène Ryu Hayabusa. Sans plus tarder, notre ninja préféré se rend à Londres et se retrouve nez à nez avec le leader du groupe terroriste autrement appelé le Régent du Masque et que vous pouvez voir ci-contre. Ce dernier lance alors à Ryu une malédiction liée aux nombreuses vies qu'il a pris. Souffrant le martyre, Ryu devra alors parcourir le monde pour sauver ses proches.