Au programme, les terres glacées sous lesquelles circulent les sous marins et sur lesquelles avancent des brise-glace cuirassés, des zones tropicales asiatiques, des bunkers faits de béton armé, ou encore une entrée de base militaire, et un environnement urbain. Comme à l'époque, Commandos 2 - HD Remaster est un jeu de stratégie et d'infiltration dans lequel il faut mener à bien diverses missions de sabotage, d'assassinat, de collecte d'informations, le tout aux commandes de quatre personnages aux capacités variées.