Dans Projet Genom, vous incarnez le survivant d'une terrible catastrophe écologique sur Terre qui vous mène alors dans un voyage à la découverte de nouvelles planètes. Ces dernières renfermeront de nombreux secrets mais aussi des faunes étrangères et de nombreux ennemis que vous pourrez découvrir à votre guise. Pour lutter contre les ennemis, le joueur aura accès à un vaste arsenal d'armes, d'équipement et de méchas. Enfin pour voyager entre les planètes, vous pourrez constituer votre propre vaisseau spatial.