Thunderbirds sur Nes est un jeu d'action dans lequel vous incarnez la célèbre équipe de la série télévisée du même nom. Un alien du nom de Hood vous somme de lui remettre les Thunderbirds, ces véhicules de secours futuristes dans un délai de 60 jours. C'est justement le temps qu'il vous faudra pour trouver les sources d'énergie de Hood, en pilotant les 5 jets de la famille Tracy, à travers le Monde entier.